学校于2015年成立创新创业工作领导小组，由校长任组长，于2016年成立创新创业学院，由分管教学和学生工作的校领导任院长。目前全校共有27个职能部门和44个教学单位的210名专职人员开展创新创业相关工作。

学校以北航科技园为枢纽平台，充分发挥学科优势，广泛集聚社会资源，全面支撑学校创新创业教育和创业带动就业工作，为师生科技成果转化和社会初创企业提供了优质的孵化支持平台，形成了“众创空间+孵化器+加速器+产业园”的创业孵化链条。学校联合社会资本设立投资基金，为科技成果转移转化建立了多层次创业投资体系，积极组织企业项目路演、股权融资对接等金融服务活动，累计服务企业150余家，促成17家在孵企业共计融资6.76亿元，上市企业3家，20余家企业获得银行小额信用贷款3000多万元。

学校每年举办“冯如杯”学生科技创新竞赛，三十年来累计有超过80000名学生参赛，收到作品50000余件，近年来本科生参与率达到90%，学校参加国家级创新创业大赛的优秀作品全部来自“冯如杯”竞赛的选拔和培育。学校在历届“互联网+”大赛中曾获得冠亚军各一次，并多次斩获金奖，在“挑战杯”竞赛中连续十六届捧得“优胜杯”更是全国唯一，突出的大赛成绩展现了创新创业人才培养的“北航模式”。